חברי ס"ג-1 משמשים ככוח עבודה בכפייה במתקן מחתרתי על עולם חייזרי לאחר שהזיכרונות שלהם נמחקים על ידי האליטה השלטת, בעוד מפקדת הסטארגייט מאמינים כי הם מתים.

אוניל וטיאלק נלכדים בלולאת זמן במפקדת הסטארגייט, כעת עליהם לחיות מחדש את אותן 10 שעות שוב ושוב, כשכל מה שהם יכולים לעשות הוא ליהנות מכך שלמעשיהם אין השלכות על העתיד.

טיאלק מתאחד עם אהובתו האבודה – אישה הטוענת כי מצאה דרך לתקשר עם השיתופן שלה שמוכן לסייע לה להביס את הגאולד.

כאשר חבר צוות של מפקדת הסטארגייט מנסה להרוג טוקרה, הטוקרה מתעקשים לגלות האם קיים מרגל הנתון לשליטה מוחית של הגאולד ומתברר כי אוניל וקרטר עשויים להיות קורבנותיה של אותה טכנולוגיה.

ארכיאולוגית של הטוקרה מגיעה למפקדת הסטארגייט עם טכנולוגיה חדשה שהתגלתה וביכולתה להעניק לחברי צוות ס"ג-1 כוחות על אנושיים.

אוניל וטיאלק מסכנים את חייהם כדי למנוע מהחרקים המשכפלים דריסת רגל ראשונה על ​​כדור-הארץ. במקביל, קרטר עוזרת לאסגרד להדוף פלישת משכפלים לכוכב שלהם.

ס"ג-1 מגלים את כוכב הלכת המיסטי קב, והוא חייבים למצוא את בנם של אפופיס ושארה לפני צבאו של אפופיס.

חפץ זר גורם לדניאל להיעלם אל מימד אחר והצוות מחפש עזרה מסבו ששוהה במוסד לחולי נפש, רק שמסתבר והוא נמצא שם בעקבות תגלית דומה לזו שעשה דניאל.

חברי ס"ג-1 נכלאים על כוכב לכת זר והופכים לכלי משחק במלחמת אידיאולוגיה.

אוניל גונב טכנולוגיה מהטולאן ונאלץ לעזוב את תוכנית הסטארגייט. מייבורן, שמעוניין לצרף אותו לשורתיו, מציע הצעה מסקרנת שמתגלה כחלק מדבר גדול הרבה יותר בעל השלכות דיפלומטיות על הכוכב.

לאחר שפגיעת מטאור קוברת את הסטארגייט, אוניל מוצא את עצמו תקוע על כוכב לכת ללא תקווה להצלה ונכנע אט אט לחייו החדשים בקרב בני הכוכב.

ס"ג-1 עוברים השתלה של שתלים מוחיים זרים הגורמים להם לחזות ביישות מוזרה, אשר אומר להם שהם לא ישרדו את הליך הסרתו.

ס"ג-1 חוזרים ממשימה ומגלים כי חייזרים משני-צורה השתלטו על מפקדת הסטארגייט ומתחזים לאנשיו. קרטר, שמצליחה להימלט, חייבת לשכנע את חיל האוויר שמדובר במצב פלישה אמיתי.

ס"ג-1 מגיעים לכוכב הסובל כולו משכחה. מנהיגת הכוכב, שמתיידדת עם דניאל ג'קסון, חוזרת לכדור הארץ יחד עם הצוות בנסיון למצוא תרופה, אבל ס"ג-1 חושדים שהיא לא מי שהיא נראית.

ג'קסון עוסק במותה של שארה שנהרגה על-ידי טיאלק בנסיון להציל את חייו, בעודו חוזה שוב ושוב בזכרונות/חזיונות מחייהם המשותפים תחת ידייה המענות אותו.

ס"ג-1 מגלים מחנה צבאי בו צעירים מאומנים להתחזות לאנשי ס"ג כדי שיוכלו לחדור לכדור-הארץ. הצוות שמבין שאנשי המחנה לא מודעים לנפילתו של אפופיס ומחליטים לנצל את המצב.

ס"ג-1 מגלים כוכב לכת שבו ילדים משמשים לרכוש ידע עבור האוכלוסייה כולה. הצוות מתחילים לשאול שאלות כאשר הם מגלים שאותם ילדים מאבדים את כל זכרונותיהם בין לילה.

ס"ג-1 חייבים להושיע מציאות חלופית של כדור-הארץ מפני פלישת גאולד לאחר שכפילים של סמנתה קרטר וצ'ארלס קאוולסקי מגיעים דרך המראה הקוונטית ומבקשים עזרה.

כאשר דניאל משתגע, ס"ג-1 חייבים להתמודד עם המורשת של טכנולוגיית נגד-הגאולד של מאצ'לו. בעוד דניאל מנסה להוכיח לכולם כי הוא לא יוצא מדעתו.

האסגרד מסיעיים לכדור הארץ במשא ומתן על הסכם הפסקת אש עם אדוני המערכת של הגאולד.

אוניל, קרטר וג'קסון מתעוררים מתוך קפאון במה שנראה כמפקדת הכוכב – כמעט 80 שנה בעתיד, ללא ידעתם של אנשי הצוות האחרים ועם ספקות גדולים במה שסופר להם.

ילד צעיר מגיע דרך הסטארגייט ומזהיר מפני מזימה של חייזרים בלתי-נראים להרוג את כל המין האנושי וזאת כדי למנוע מבני האדם לשמש את הגאולד כמארחים פוטנציאליים.

אפופיס, האויב הגדול ביותר של ס"ג-1, מחפש מפלט מסוקאר ומגיע לסף מותו במפקדת הסטארגייט, שם סוקאר דורש את נקמתו באפופיס ומאיים להחריב את כדה"א באם לא ייענה.

קבוצה של חייזרים פרימיטיביים מתחילים ליפול למשכב וקרובים למוות לאחר שס"ג-1 מגיעים לכוכבם, וכשהצוות אובד עצות, נדמה כי את הדבר שגרם לאסון לא ניתן לעצור.

ס"ג-1 מגיעים למעבדתו של אדם מבוגר וגוסס שידוע בפיתוח טכנולוגיה להילחם בגאולד. דניאל מרומה להחליף את גופו עם אותו אדם, מאצ'לו, שמאמין שזה גמולו על מלחמתו בגאולד.

לאחר שהצוות מגיע לעולם על קצהו של חור שחור, מפקדת הסטארגייט לא מצליחה לנתק את הסטארגייט. כעת כל כדור-הארץ נמצא בסכנה בגלל שדה כבידה מעוות-זמן.

אוניל, בעל כורחו, הופך להיות כלי קיבול לספרייה של ידע זר. עד מהרה הוא מבין שעליו להיפטר מהידע שבראשו בטרם יקרוס תחת העומס על מוחו והוא מתחיל לבנות מכשיר שיעזור…

טיאלק נעקץ ע"י חרק ענק וקטלני ומוחדר לגופו ארס רעיל, טיאלק שמתחיל טרנספורמציה נוראית שבסופה גופו ישרוץ חרקים נמצא במנוסה. כעת ס"ג-1 חייבים למצוא אותו לפני קולונל מייבורן.

הצוות מגיע לכוכב שנשלט על-ידי מה שנראה כגאולד, אך טומן בחובו הרבה יותר מהנראה לעין. ג'קסון הופך מכור להשפעת סרקופג של הגאולד ונופל לרגליה של הנסיכה המניפולטיבית של הכוכב.

ס"ג-1 כלואים במציאות וירטואלית בעודם נאלצים לחיות מחדש את הרגעים הגרועים ביותר של חייהם שוב ושוב – דניאל חוזה במות הוריו, אוניל במות חברו לצוות וקרטר במות אימה, והכל בשם…

קרטר נתונה לשליטתה של גאולד הטוענת שהיא אויב של אדוני המערכת, טוקרה בשם ג'ולינאר, הנמצאת במנוסה מפני מתנקש מיומן של הגאולד המבקש לשים קץ לחייה.

חברי ס"ג-1 מגיעים אל P3X-989 והם מאבדים את הכרתם זמן לא רב לאחר הגעתם. הם מתעוררים וחוזרים לכדור הארץ רק כדי לגלות שהם לא בדיוק עצמם.

קולונל אוניל וקפטן קרטר מופרדים מג'קסון וטיאלק במהלך מעבר בסטארגייט ונלכדים על עולם קרח שומם, בלי שום דרך לברוח. כעת עליהם לעשות הכל כדי לשרוד.

צוות ס"ג-1 מציל קבוצה של אנשים מתקדמים מכוכב שקרוב לחורבן. אותם אנשים, בני הטאלון, חייבים כעת למצוא בית חדש לפליטיהם לפני שהפנטגון יניח עליהם את ידיהם.

מחלה מסתורית מוחה את כל אוכלוסייתו של כוכב חייזרי לאחר שצוות של ס"ג מגיע אליו. משום מה, נערה אחת שורדת ואיתה קרטר מתיידדת, אבל היא מגלה שהיא מנוצלת על ידי…

הגאולד המגורשת האתור נמצאת בסרקופג עתיק על כדה"א. לאחר שזו מתעוררת לחיים, היא משתלטת על מפקדת הסטארגייט בתקווה לגייס צבא חדש נגד אדוני המערכת.

טיאלק חוזר לצ'ולאק כדי למנוע מבני עמו להשתיל בבנו, שהגיע לגיל בגרות, זחל גאולד. לשם כך הוא נעזר במורהו הוותיק, ברייטאק וחברי ס"ג-1 שמתלווים אליו.

דניאל נלקח בשבי על ידי חייזר עם סדר יום מוסתר. בעוד ס"ג-1 נוטים להאמין שהם חזו במותו, מאוחר יותר מתברר כי אותו חייזר שתל במוחותיהם זכרונות שווא כדי שיוכל לברר…

ס"ג-1 מגלים גזע של אנשים יפיי מראה שמתבגרים במהירות רבה. המצב נעשה אישי כאשר אוניל מתחיל לסבול מאותה הזדקנות מואצת ועתה חייב לחיות את שארית חייו על אותו כוכב.

במהלך משימה מחוץ לעולם, ג'ק נפגע על ידי אנרגיה מן קריסטל כחול… אשר יוצר כפי שחוזר לכדור הארץ במקומו של ג'ק.